Diferensiasi Misi adalah strategi yang dilakukan AMIKOM Surakarta untuk menciptakan identitas dan fokus yang ditetapkan (Pendidikan, Penelitian atau Pengabdian kepada Masyarakat) dengan mengembangkan tujuan khusus yang berbeda dari pesaing, memanfaatkan kekuatan dan keahlian sumberdaya yang dipunyai, serta menyesuaikan diri dengan kebutuhan pemangku kepentingan (internal dan eksternal) dalam konteks kearifan local menuju daya saing dan keunggulan kompetitif nasional.

AMIKOM Surakarta (dalam perkembangan institusi AMIK, STMIK dan Universitas) telah menetapkan diri sebagai institusi dengan Fokus Pengembangan Pendidikan dalam Bidang Ilmu Komputasi.